贺丹^1,2 , 苏晓迪¹ , 何松林^1,2* , 张佼蕊¹ , 谢栋博¹ , 王政¹ , 刘艺平¹ , 张曼¹

1 河南农业大学林学院, 郑州, 450002; 2 河南科技学院园艺园林学院, 新乡, 453003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2019年01月14日    接受日期: 2019年02月14日    发表日期: 2020年04月30日

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为了研究牡丹、芍药远缘杂交胚败育的分子机理，本研究使用 BGISEQ-500 平台对牡丹、芍药杂交种胚转录组进行测序，通过测序，共得到了 92.02 Gb 数据。通过拼接组装去冗余后得到了 86 195 个 Unigene，平均长度为 1 189 bp。86 195 个 Unigene 在七大功能数据库中进行注释，最终分别有 49 172 (NR: 57.05%)、38 352(NT: 44.49%)、36 477 (SwissProt: 42.32%)、38 905 (KOG: 45.14%)、37 993 (KEGG: 44.08%)、26 832 (GO: 31.13%)以及 37 758 (Pfam: 43.81%)个 Unigene 获得功能注释。同时还检测出 21 998 个 SSR 分布于 17 567 个 Unigene中，其中二核苷酸和三核苷酸这两种重复类型分别有 5 628 个和 2 906 个。在 17 567 个 Unigene 中预测出1 671 个编码转录因子。不同发育时期的胚转录组数据中共筛选出 13 974 个差异表达基因，其中上调基因有 8 647 个，下调基因有 5 327 个。该转录组测序分析为寻找牡丹、芍药远缘杂交胚败育相关基因提供了一定的理论参考。

芍药(Paeonia lactiflora)；种胚；高通量测序；转录组